PCR擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區域：試劑貯存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物配制和擴增區、擴增產物分析區。為避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行，即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。 各實驗區之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。
臨床PCR實驗室設計的“16字口訣”：各區獨立、注意風向、因地制宜、方便工作。
(1)在物理空間上，必須是完全相互獨立的，各 區域無論是在空閑還是在使用中，應始終處于 完全的分隔狀態; (2)不能有空氣的直接相通。
墻面：主體結構建議使用彩鋼板圍護，墻面光潔、不產塵積塵、耐腐蝕，易清潔、無縫隙；
地面：建議使用PVC卷材，、耐腐蝕、無縫隙、無滲漏；
陰陽角：均采用圓弧角密封處理，不易積塵；
傳遞窗：必須設置互鎖(機械或電子)；
主入口：實驗室主入口設有門禁管理；
通風系統：避免交叉污染；
排風系統：宜設置過濾器凈化；
氣流組織：采用上送下排形式；
壓力梯度：壓力梯度控制通過微壓差計及精密自控系統控制；
排水系統：排水系統應不滲漏，下水應有防回流設計。
應急用電：應有緊急發電設備或雙回路供電。關鍵設備應配備足夠的UPS并接入設備。
防護設施：設置洗眼裝置，必要時應有應急噴淋裝置；設置非接觸式操作理念(感應式水、感應式自動門、互鎖傳遞窗等)。
PCR實驗室又叫基因擴增實驗室，實時熒光定量PCR技術是DNA定量技術的一次飛躍，是用于放大特定的DNA，可看作生物體外的特殊DNA。通過DNA基因系統，能迅速掌握患者體內的病毒含量，其度高達納米級別。
PCR檢測方法具有靈敏度高、特異性高、快捷、對樣品要求低等優點，因此被臨床醫生廣為認可，已廣泛應用于醫院的臨床診斷和各防疫檢測部門的禽疫病診斷。
在國家政策和疫情發展的推動下，各地區各級醫院都開始或者準備建立獨立合規的PCR實驗室，都已具備核酸檢測能力已經成為各機構。但由于各地區疫情的差異化使得長期低風險地區的一些核酸實驗室除了具備應急功能之外幾乎處于停滯狀態。此類情況也是各級醫院領導在建立實驗室擔心的問題，投入了資金和精力但又不能給醫院帶來創收。
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